V októbri 2003 ruského ropného magnáta Michaila Chodorkovského zatkol špeciálny oddiel ruskej polície v sibírskom meste Novosibirsk, ktorý ho okamžite obvinil z daňového úniku a z podvodu veľkého rozsahu. Zatknutý Michail Chodorkovskij predal kontrolnú väčšinu ropného koncernu Jukos svojmu partnerovi Leonidovi Nevslinovi a potvrdil, že od predaja spoločnosti Juganskneftegaz, ktorá je divíziou koncernu Jukos, nie je viac zodpovedný za obchody spoločnosti. Chodorkovskij je už vyše roka vo vyšetrovacej väzbe. Hlavným dôvodom väzby je podľa neho samotného podpora opozičných politických strán. Oficiálne je však obvinený z podvodu a sprenevery.

Moskovské hospodárske noviny Vedomosti oznámili, že podľa stanov finančnej skupiny Menatep, v ktorej sú vlastníci Jukosu, zanikli práva Chodorkovského po nútenom predaji spoločnosti Juganskneftegaz minulý rok v decembri. Ruská vláda, ktorá neuznáva právomoc amerického súdu, vtedy Juganskneftegaz vydražila za 9,4 miliardy USD, čo je v prepočte asi 275,6 miliardy SKK. Kúpila ho dovtedy neznáma firma Bajkal Finance Group. Následne Juganskneftegaz kúpil štátny ropný podnik Rosnefť, ktorý má blízke vzťahy s Kremľom.

Dôvodom aukcie boli daňové nedoplatky vo výške 27 miliárd USD, čo je v prepočte asi 796,8 miliardy SKK, ktoré Jukos dlhuje štátu. Jedným z cieľov aukcie bolo opäť získať Jukos do vlastníctva štátu po tom, čo došlo k jeho chaotickej privatizácii v polovici 90. rokov.

Ruská vláda pravdepodobne v máji, prípadne aj skôr, oddelí od ruskej ropnej spoločnosti Jukos ďalšiu kľúčovú výrobnú divíziu Samaraneftegaz, informovali o tom zdroje 25. januára tohto roka.

V roku 1998 vyťažila spoločnosť Jukos 44,6 milióna ton ropy, v roku 2000 to bolo 49,5 milióna ton, v roku 2003 sa objem ťažby zvýšil na 80,8 milióna ton. Prognózy spoločnosti uvedené na jej internetovej stránke na rok 2004 boli 86 miliónov ton ropy. Za 1. polrok 2004 objem ťažby ropy a zemného plynu predstavoval 42,4 milióna ton, čo bolo o 8,7 % viac ako za rovnaké obdobie roku 2003.

V 1. polroku 2004 Jukos exportoval ropu za hranice Ruskej federácie v objeme 26,8 milióna ton, čo bolo o 13,3 % viac ako za rovnaké obdobie 2003.