Partnerské krajiny programu PHARE, ktoré spĺňajú túto podmienku, si určia prioritné oblasti pre využitie financií v rámci, odsúhlasenom Európskou úniou. Výsledkom tohto spoločného procesu sú Indikatívne programy, ktoré pokrývajú trojročné obdobie.
Únia na jednej strane tvrdí, že jej stratégie, ako napríklad program PHARE, sú riadené dopytom, na strane druhej diktuje štruktúru, v ktorej sa tieto potreby napĺňajú. Štáty prijímajúce pomoc, nakoľko nie sú členmi Únie, majú len malý vplyv na legislatívne a politické procesy EÚ. Je zložité umožniť im zvýšenie vplyvu bez zmien v už aj tak tak ťažkopádnom a neprehľadnom procese tvorby politiky v EÚ. Prístup krajín strednej a východnej Európy na Súdny dvor je tiež obmedzený.
Napriek nepochybnému prínosu, ktorý bude mať angažovanie EÚ na riadenie environmentálnej kvality v strednej a východnej Európe, iróniou ostáva, že politika EÚ, vrátane programu PHARE, pravdepodobne zároveň prispieva k zhoršovaniu životného prostredia. Príčiny súvisia s neúspechom EÚ pri integrácii environmentálnych aspektov do ďalších oblastí politiky a v pokračujúcom uprednostňovaní ekonomickej reštrukturalizácie pred ochranou životného prostredia. Príkladom je rozvoj v oblasti dopravnej infraštruktúry.