Každoročne sa organizujú desiatky konferencií, seminárov, okrúhlych stolov, ktoré sa venujú treťosektorovej problematike. Významné miesto medzi nimi patrí Stupavskej konferencii, celoslovenskému výročnému stretnutiu MVO, ktoré hodnotí vývoj sektora a určuje ciele do ďalšieho roka. Stupavská konferencia volí aj Grémium tretieho sektora, dobrovoľnú skupinu lídrov MVO, ktorej základným poslaním je obhajovať a presadzovať záujmy mimovládnych organizácií, rozvíjať spoluprácu a solidaritu v rámci tretieho sektora, vysvetľovať a popularizovať úlohu tretieho sektora doma i v zahraničí. V Grémiu majú zastúpenie MVO nielen podľa oblasti svojej činnosti, ako aj podľa krajov, v ktorých pôsobia krajské grémia tretieho sektora. Doteraz sa uskutočnilo šesť riadnych a jedna mimoriadna Stupavská konferencia.
Vlastné štruktúry, ktoré si sektor vytvoril počas desať rokov svojej novodobej existencie, mu pomáhajú reagovať na jeho konkrétne potreby ale aj vstupovať do diskusií, partnerstiev a spolupráce s inými dôležitými skupinami v spoločnosti. Okrem Grémia tretieho sektora na Slovensku fungujú viaceré strešné organizácie, ktoré operujú na národnej úrovni, ale aj MVO poskytujúce rôzne služby na národnej a regionálnej úrovni. Či už je to ChangeNet, kľúčový pre internetovú komunikáciu, alebo SAIA-SCTS, najstaršie servisné centrum so sieťou pobočiek vo všetkých krajoch Slovenska. MVO vstupujú do rôznych koalícií, aby mohli reagovať na špecifické potreby sektora. Príkladom sú rôzne zoskupenia zamerané na regionálny rozvoj úzko prepojený s decentralizáciou štátnej správy a navrhovaným novým územnosprávnym členením SR, alebo skupiny, ktoré sa usilujú vstupovať do rozhodovacích procesov súvisiacich so vstupom SR do Európskej únie. Vznikajú nové typy organizácií, ktoré doteraz nemali zastúpenie v širokom spektre MVO. Môžeme tu spomenúť aspoň málopočetnú ale silnú skupinu analytických MVO (tzv. “think tanks”), ktoré vo veľkej miere ovplyvňujú názory verejnosti ale aj politikov a predstaviteľov štátnej správy. A patria sem aj desiatky iniciatív s komunitným programom, ktoré prispievajú k zvyšovaniu kvality života v danej komunite. Význam dobrovoľníctva, teda finančne nehonorovanej práce, vystupuje do popredia. Podmienky rozvoja dobrovoľníctva sa stávajú jednou z často diskutovaných tém.