Súbor AUTOEXEC.BAT vlastne šetrí užívateľovi prácu, pretože nie je problém nainštalovať systém tak, aby automaticky po zapnutí počítača spúšťal akúkoľvek konkrétnu aplikáciu. Napr. môže pri štarte urobiť antivírovú kontrolu, nastaviť cesty k programom a prípadne priamo spustiť obľúbený program.

Operačný systém MS-DOS sa však neskladá iba z týchto troch príkazov (IO.SYS, MSDOS.SYS, COMMAND.COM – tie tvoria iba jeho jadro a veľkosťou iba malú časť) a zo súborov AUTOEXEC.BAT a CONFIG.SYS. Všetky externé príkazy, systémové súbory, drivery a ďalšie časti operačného systému sú uložené v adresári, ktorý sa obvykle nazýva DOS a je umiestnený hneď pod hlavným (koreňovým) adresárom disku.
Operačné systémy sa obvykle dodávajú výrobcami počítačov v stále novšej a novšej verzii v závislosti od vývoja. Nachádzajú sa sčasti v operačnej pamäti a sčasti vo vonkajších pamätiach počítača a sú stále k dispozícii. V súčasnosti sa prechádza na produktívnejšie a modernejšie operačné systémy, napr. WINDOWS, UNIX., LINUX, OS/2, ktoré sú dodávané už na externých médiach vyššej úrovne CD-ROM.