Pre integráciu dát a aplikácií sú k dispozícii rozhrania:

ALE: Aplication Link Enabling – integrácia procesov presahujúcich systém
EDI: Electronic Data Interchange – Elektronická výmena dokumentov
OLE: Object Linking and Embedding – Komunikácia v sieti prostredníctvom OLE
DDE: Dynamic Data Enchange – Výmena dát na úrovni prezentácii (klienta)
Mail: Rozhranie k systému elektronickej pošty
RFC: Remote Function Call – Komunikácia v sieti medzi programami, volanie funkcií
Q-API: Queue API – Rozhranie pre asynchronnu, bufferovanú, výmenu dát v sieti
CPI-C: Common Programing Interface – Communication
Programové rozhranie pre synchrónnu komunikáciu v sieti.

Všetky aplikačné programy v systéme R/3 sú vo vlastnom interpretačnom jazyku SAP-ABAP/4 s dialogóvym interprétom DYNPROS (dynamické programy) a sú skupinou procesov (server) pre danú službu. Pozor, pod pojmom server rozumieme tiež počítač na ktorom sú poskytované služby (service = orientované hardvérovo), čo však nie je člen vrstvy R/3 (s výnimkou Terminal Serveru). Databázový server môže byť jeden centrálny počítač, resp. RACK – diskové polia s radičom na niekoľko databázových počítačov.
SAP používa RDBMS, relačný databázový systém a Open SQL na manipuláciu s dátami. Open SQL a Native SQL (Embedded) sú implementované do jazyka SAP-ABAP, čo zaručuje úplnú kompatibilitu a funkčnosť.

Centrálny systém:

Centrálny systém SAP R/3 pozostáva z jedinej inštancie, v ktorej sú všetky služby SAP. Spolu s centrálnym systémom je v doméne LAN min. GatewaySAP server a Message server. Centrálny systém sa veľmi ľahko rozširuje na distribuovaný a môžu byť pripojené ďalšie inštancie – administratívne jednotky poskytujúce služby.

Prístup do databázy R/3:

Prístupové možnosti externé aj interné podliehajú koncepcii prideľovania oprávnení administrátorom databázy systému R/3. Každé oprávnenie prístup musí byť pridelené a overované administrátorom. 1. Vlastné aplikácie
Prístup na zapisovanie, čítanie a zmenu údajov z databázy R/3 má aplikačný server, prostredníctvom aplikácie ktorá spracováva požiadavky
klientov.
2. Cudzie aplikácie
a. Priamy prístup – len na čítanie, prostredníctvom SQL, alebo iných
rozhraní napr. ODBC (MS Access, Visual Basic)
b. Prostredníctvom aplikačného serveru – pomocou RFC a OLE
c. Prostredníctvom prezentačného serveru – zo systému R/3 môžu byť prenesené a poskytnuté dáta prezentačný server pre externé aplikácie.
Hardvérovo prístup na databázový server majú aplikačné servery (LAN) a GatewaySAP server, ktorý zabezpečuje komunikáciu systému v sieti. V prípade, že aplikačné servery sú dislokované mimo LAN databázového serveru, tak majú prístup cez GatewaySAP server. Za GatewaySAP je umiestnený Proxy server a FireWall lokality LAN v ktorej sa nachádza databázový server. V praxi sú databázový server a aplikačné servery umiestnené v jednej doméne LAN.
SAP komunikuje v sieti okrem protokolu TCP/IP aj so staršími systémami (R/2, IBM, mainframe) protokolom SNA LU 6.2.