Pomoc sa v čoraz väčšej miere sa uplatňujú pravidlá decentralizácie a demokratizácie, ktoré na jednej strane zjednodušujú programový a hlavne realizačný cyklus, na strane druhej vyžadujú, aby sa kandidátske krajiny rýchlo adaptovali na zmeny v organizácii a postupoch poskytovania pomoci. V poslednom období to boli najmä zmeny týkajúce sa twinningu ako hlavného nástroja budovania inštitúcii, princípu spolufinancovania jednotlivých projektov a princípu účelovosti jednotlivých projektov. Od roku 2000 sa začalo ďalšie programové obdobie (2000 – 2006). Európska únia v rámci dokumentu Agenda 2000 schváleného na Berlínskom summite v marci 1999 vyčlenila pre kandidátske krajiny tri nástroje predvstupovej pomoci: PHARE 2000 (Action plan for coordinated aid to Poland and Hungary), ISPA (Instrument for Structural Policies for Pre-Accession) a SAPARD (Special Aid for Pre-Accession measures for Agriculture and Rural Development). Celková predvstupová podpora pre asociované krajiny v programovom období 2000 až 2006 bola stanovená v objeme 3,12 mld. eur ročne. Cieľové zameranie jednotlivých programov je takéto:
1. Program PHARE je v kompetencii Generálneho riaditeľstva (Direction Générale – DG) pre rozšírenie a sústreďuje sa na opatrenia spojené s prijatím acquis communautaire, napr. budovanie správnych a inštitucionálnych kapacít kandidátskych krajín a financovanie investícií, ktoré by kandidátskym krajinám mali pomôcť prispôsobiť sa právu spoločenstva. Od roku 2000 bude program PHARE podporovať aj investície do ekonomickej a sociálnej súdržnosti v kontexte predbežných Národných plánov rozvoja.
2. Program ISPA (riadený DG pre regionálnu politiku) sa zameriava na podporu projektov rozvoja infraštruktúry v oblasti dopravy a životného prostredia. Prostriedky sa delia rovnakým dielom medzi dopravný sektor a sektor životného prostredia. Na jeden investičný projekt je stanovený minimálny rozpočet 5 mil. EUR, pričom úniou bude krytých maximálne 75% výdavkov (vo výnimočných prípadoch 85%). V oblasti životného prostredia je základným cieľom to, aby pristupujúce krajiny vyhovovali všetkým normám stanoveným v acquis na dodávky pitnej vody, čistotu vôd, znečistenie ovzdušia a pevné odpady. Celkové odhadované investičné náklady v krajinách SVE na dosiahnutie úplnej kompatibility s legislatívou EˇU týkajúce sa životného prostredia boli vyčíslené na 100 mld. EUR. Príklad výpočtu prostriedkov z fondu ISPA pre jednotlivé krajiny podľa úniou stanovených kritérií a z toho vypočítaný percentuálny podiel je uvedený v tabuľke.