Hlavné mesto SR Bratislava sa dohodlo so Železnicami SR, SAD Bratislava a s DPB, a.s., že od 1.1.2001 začnú trvalú prevádzku prvou etapou integrovaného dopravného systému na území hlavného mesta pod názvom Bratislavská integrovaná doprava (BID). Rozšírenie integrovaného dopravného systému o služby prímestskej autobusovej dopravy na územie celého mesta naraz by bolo veľmi náročné z hľadiska organizačného aj technického a v danej etape by bolo aj finančne nezvládnuteľné. Preto bolo dohodnuté, že SAD Bratislava sa na začiatku zapojí do systému iba v jednom smere. Počas experimentu integrácie dopravy v roku 2000 bola najviac využitá železničná trať v smere na Záhorie. Až 68.9 % mimobratislavských cestujúcich, ktorí si kúpili kupón na integrovanú dopravu, cestovalo zo smeru Malacky. Aj obyvatelia Bratislavy najviac využívali túto trať. Z kupónov zakúpených bratislavčanmi si 52.7 % kúpili obyvatelia mestských častí priľahlých k trati zo Záhoria. Tento výrazný záujem o integrovanú dopravu v smere Záhorie viedol k výberu o smere zapojenia SAD Bratislava do BID. Od 1. februára 2001 možno v rámci BID a na cestovný lístok na BID cestovať na všetkých tratiach ŽSR na území mesta Bratislavy vo všetkých osobných a zrýchlených vlakoch. Osobné a zrýchlené vlaky ŽSR je možné využívať medzi stanicami Hlavná stanica, Devínska Nová Ves, Lamač, Železná studienka, Vinohrady, Predmestie, Rača, Vajnory, Nové Mesto, Petržalka, Rusovce, Podunajské Biskupice, Ústredná nákladná stanica. V autobusoch SAD Bratislava možno cestovať na trati Autobusová stanica Mlynské Nivy - Záhorská Bystrica. V rámci BID je môžné použiť autobusy SAD na zastávkach Krče, Pri krematóriu, Vrančovičova, Záluhy, Patrónka, Račianske mýto a AS Mlynské nivy v obidvoch smeroch premávky.