Jozef Mengele sa narodil 16. Marca 1911 v Gunzburgu, Nemecku ako najstarsi z 3 synov bavorskeho priemyselnika Karla Mengeleho a matky Walburgy. Jeho dvaja bratia boli Karl(1912-1942) a Alois(1914-1974).

Bol inteligentnym a ambicioznym studentom. Studoval filozofiu na univerzite v Mnichove a medicinu vo Frankfurte. Na univerzite v Mnichove ho ovplyvnili nazory nacionalneho socializmu. Studoval u Ernsta Rudina, tvorcu zákona o nutenej sterilizacii a hlavneho obhajcu teorie, podla ktorej je lekar povinny ukoncit ”nehodnotny” život. Doktorat filozofie ziskal u prof. T. Mollisona, ktory tvrdil, ze staci jeden pohlad na fotografiu, aby zistil, ci ma dotycny zidovskych predkov. Vo svojich studiach sa zameriaval hlavne na antropologiu a genetiku.

V roku 1937 dostal miesto asistenta v Ustave pre vyskum dedicnosti, biologie a rasovej cistoty vo Frankfurte, ktory mal v Tretej risi vysadne postavenie. Pracoval v tyme popredneho europskeho genetika prof. Otmara von Verschuera.V roku 1937 vstupil do NSDAP a o rok neskor do SS, ktora sa vydavala za ochrancu rasovej cistoty. Roku 1940 vstupil do Waffen SS a jeden rok sluzil v urade SS pre rasy a presidlenie, kde skumal rasovu vhodnost Poliakov.V polovici roku 1941 bol prelozeny na front na Ukrajinu. V 1942 bol zraneny, za co bol vyznamenany Zeleznym krizom prveho stupna. Bol preveleny naspat k Verscheurovi, ktory sa zatial stal riaditelom Vyskumneho ustavu cisara Wilhelma pre antropologiu, ludsku genetiku a eugeniku (veda o slachteni ludskej rasy). Tu sa zoznamil s pracou v koncentracnych taboroch. V mají 1943 odisiel do Osviencimu – bol tu dostatok “experimentalneho materialu”.

Vrokoch 1943-44 mal koncentracny tabor Osviencim (Auschwitz Birkenau) 5 krematorii a plynovych komor, v ktorych bolo zavrazdenych az 9000 ludi denne. Vacsina lekarov SS pokladala svoju pracu ako krajne tazku a odpornu, Mengele však nie, dokonca si vnej nasiel zalubenie. Povinnostou lekara bola aj prehliadka, tzv. selekcia, novych vaznov, ktori boli denne privazani v preplnenych dobytcich vagonoch. Pocas selekcie na muzov a zeny, si medzi vaznami vyhladaval dvojcata, ktore boli predmetom jeho vyskumu. Podla spomienok vaznov, ktori prezili, a spolupracovnikov Mengele, inak fesak, bol vždy elegantne obleceny s bielymi rukavicami a dokonale nalestenymi ciernymi topankami a nosil neodmyslitelny bicik.Bol taky cynicky, ze pocas selekcie si dokonca popiskoval oblubene operne arie.