Vodca ho poveril, aby sa do konca augusta pripravil a až to bude treba zahral divadlo, ktoré bude slúžiť ako zámienka na vojnu s Poľskom. Všetko malo vyzerať tak, že vojnu zavinili Poliaci, ktorí prví napadli nemecké územie. Pre celú provokáciu vybral Heydrich nemeckú vysielaciu stanicu v Hornom Sliezsku, ležiacu pri hraniciach s Poľskom. Technický personál vysielača bol večer 31. augusta 1939 napadnutí 6 mužmi v otrhaných poľských uniformách (v skutočnosti to boli ľudia z SS). Pred mikrofónmi vysielača prebehla prestrelka a vysielač sa odmlčal. Pre Hitlera sa toto divadlo stalo zámienkou, aby žiadal vyhlásenie vojny proti Poľsku. Západní spojenci vyhlásili vojnu Nemecku až 3. septembra. 27. septembra boli v Nemecku preorganizované všetky bezpečnostné zložky. Nový úrad, ktorému malo všetko podliehať sa volal RSHA – RichsSicherheitsHauptAmt (Hlavní ríšsky bezpečnostný úrad). Jeho šéfom sa stal Himmler. Skladal sa z Gestapa, Kriminálnej polície, domácej a zahraničnej rozviedky. Najstrašnejšou vecou, na ktorej sa Heydrich podieľal bola príprava riešenia židovskej otázky, likvidácie celej európskej židovskej populácie. Na konferencii vo Wannsee, 20. januára 1942 padlo rozhodnutie o likvidácii 11 miliónov Židov. Zúčastnili sa jej aj generáli SS Müller a Eichman, ktorí priamo organizovali akciu. Vrchným zástupcom nemeckej moci v protektoráte bol zastupujúci ríšsky protektor. Od začiatku okupácie to bol diplomat Konstantin von Neurath. Hitler ho donútil, aby sa vzdal svojej funkcie. Bol nahradený 38 ročným Heydrichom generálom Gestapa a organizácie SS. Heydrich začal okamžite tvrdo vládnuť, vyhlásil stanné právo a zriadil zvláštne súdy, ktoré hneď vyniesli niekoľko trestov smrti. K smrti bol odsúdení aj generál Eliáš. Zatiaľ však bol uväznení len ako rukojemník, popravení bol až v priebehu heydrichiády. Strieľanie do ľudí bolo len krvavou kulisou pre to, čo Heydrich považoval za svoj hlavný cieľ – teda konečnú germanizáciu českého územia. Najvyšší veliteľ prikázal zničiť symbol českého odboja – Hrob neznámeho vojaka na Staromestskom námestí. Domáci odboj bol rozdrvený za niekoľko dní. Zavraždených bolo mnoho ľudí v policajných celách Gestapa. Prezident Beneš sa obrátil so svojimi problémami na prednostu československej spravodajskej sekcie v Británii na plukovníka Františka Moravca. 3. septembra Moravec zorganizoval poradu. Pri tejto schôdzi boli naplánované jednotlivé parašutistické skupiny. Parašutisti mali byť použitý k veľkej sabotážnej kampani. Vznikli programy Silver – A, B, C; Iron - Antthropoid, Out Distance, Bivouac, Bioscop, Intransitive a Tin.