V rámci programu boli tiež dva atentáty, ktoré mali splniť skupiny Anthropoid a Tin. V jeseni sa Heydrich dopustil toľko krívd na českom národe, že bol hlavným cieľom atentátu. Na výbere Heydricha ako obeti sa podieľala hlavne britská tajná služba Intelligence service (IS).Mnohí sa dôvod považujú rozpory medzi Heydrichom a admirálom Canarisom, šéfom Abwehru – nemeckej vojenskej rozviedky. Atentát na zastupujúceho protektora Obergruppenführera SS Reinharda Eugena Tristana Heydricha bol spáchaný skupinou Anthropoid, ktorá sa skladala z rotmajstra Josefa Gabčíka a rotmajstra Jana Kubiša, vysadených nad protektorátom Čechy a Morava 29. decembra 1941 o 2:24 hodine.
Tma a oblačnosť spôsobili, že ich Halifax (bombardér upravený pre výsadkárov) nevysadil na letisku Borek, neďaleko Plzne, ale v dedine Nehvizdy, necelých 15 km od Prahy. Pri vysadení neodhadol Gabčík správne výšku a po tvrdom doskoku na zamrznutú pôdu si poranil ľavú nohu. Bez kolegovej pomoci nebol následkom zranení sám schopný chôdze. Kým Gabčík pálil na snehu padáky, Kubiš prehľadal okolie. Podarilo sa mu nájsť starú búdu, v ktorej ukryli vybavenie (revolvery, ručné granáty, kapsy s jedom, samopal Sten a špeciálne nálože). Zjedli hovädziu konzervu a čokoládu a vyrazili cez zamrznuté pole hľadať lepší úkryt. Neďaleko objavili starý kameňolom a skryli sa v jednej z opustených štôl. Gabčíka s Kubišom objavil miestny hájnik, v ktorom nízko letiaci Halifax vzbudil podozrenie, že sa deje niečo neobvyklé. Nenáročná prieskum ho ráno doviedol k spáleným padákom, v búde potom objavil ukryté vybavenie a prázdnu anglickú konzervu. Netrvalo dlho a stopy ho doviedli k dvom mladíkom ukrytých v lome. Neznámi priznali, že sú parašutisti z Anglicka a požiadali o pomoc. Znepokojila ich informácia, že sú 15 km od Prahy. Vzhľadom na Gabčíkov stav nemohli byť vyhliadky horšie.
Anthropoid zachránil len šťastná náhoda. Hluk leteckých motorov upútal tiež pozornosť mlynára zo susednej obci, ktorého napadlo, že môže ísť o výsadok. Vydal sa hľadať parašutistov a zakrátko ich našiel v lome. Mlynár bol členom športového hnutia Sokol – zasväteného československej veci od prvého dňa republiky. Muž ponúkol rotmajstrom kontakt na ilegálnu sokolskú organizáciu v Prahe. S pomocou členov sokolskej organizácie prišli členovia desantu Anthropoid začiatkom nového roka vlakom do Prahy. Neskôr prišli aj ich zbrane. Odbojovú sieť, ktorá sa ujala atentátnikov, viedol niekdajší učiteľ chémie a predstaviteľ organizácie Sokol Ladislav Vaněk, alias JINDRA z Brna, ktorý bol posledný rok a pol na úteku pred gestapom.