O uhorské dejiny sa zaujímal aj ako dvorný historiograf. Verejnú a politickú činnosť rozvinul najmä v Prahe. Stýkal sa s poprednými učencami, príslušníkmi šľachty i meštianstva, nepodarilo sa mu však preniknúť na dvor Rudolfa II. R. 1608 sa zúčastnil na korunovácii Mateja II. za uhorského kráľa v Bratislave. V júli 1618 ho zatkli a do konca roka väznili v Bratislave a vo Viedni a vyslobodili na zásah čes. stavov a za výmenu. Po návrate do Prahy pokračoval v aktivite na univerzite i v boji proti Habsburgovcom.
Po prehratej bitke na Bielej hore a po obsadení Prahy cisárskym vojskom ho medzi prvými zatkli. Pretože verejne vystupoval proti panovníkovi, potrestali ho vytrhnutím jazyka, verejným sťatím a rozštvrtením. Popravili ho spolu s ďalšími 26 čes. pánmi na Staromestskom námestí. Jeho literárne dielo v čes. krajinách po poprave systematicky ničili, takže sa zachovalo najmä v nem. univerzitných knižniciach, čiastočne na území Slovenska. Bol významný predstaviteľ humanitnej vzdelanosti, medicíny, filozofie, dejateľ čes. protihabsburského odboja, čes. a slov. kultúry.
Niektoré diela: De divina humanague philosophia, Venezia 1591, Witterberg 1593, Caroli Sigonii de dialogo liber. Leipzig 1596, Academiae Witerbergensis studiosis. Leipzig 1596,
De vita et morte…Tychonis Brahei. Pa 1601, De cavenda tollendague peste. Pa 1606, Ad Matthiam II. oratio inauguralis. Viedeň 1611, K jeho milostem stavúm království českého …
z strany vzdělání a vyzdvižení akademie pražské…učiněné ohlášení. Pa 1619.
Slovenské vydanie: Traktát o kostiach. Mt 1981.