Lesy podhorského a horského stupňa Malej Fatry majú veľmi bohatú flóru. Iný charakter má však v lese ihličnatom a iný v lese listnatom. Všetky rastliny, nielen chránené, si museli vydobyť svoje miesto v určitom type lesa. Hoci hlavnou zložkou horských porastov sú stromy, predsa existuje okrem ich vplyvu celý rad ďalších činiteľov, ktoré sa podieľajú na tom, čo kde bude rásť. K týmto činiteľom patrí napríklad obsah humusu, živín a zastúpenie mikroorganizmov v pôde, svetlo prenikajúce cez koruny stromov, vlaha, priestor a podobne. Rozmanitosť na jednej strane a harmónia týchto činiteľov v lesných spoločenstvách na strane druhej sa odráža v každom type lesa. Každý má svoje charakteristické usporiadanie drevín, bylín, machov, lišajníkov a húb. V podhorskom stupni Malej Fatry prevažujú dnes bučiny, ktoré tu zaberajú rozličné stanovištia a tak vytvárajú mnoho typov. V nich sa vyskytuje pestrá paleta rastlinných druhov, z chránených sú to orlíček obyčajný, črievičník papučkový, ľalia zlatohlavá, jelení jazyk celistvolistý a tis obyčajný. V horskom stupni sa dnes vyskytujú prevažne smrečiny, i keď prechod od bučín k smrečinám nie je ostrý a niekde sa v horskom stupni vyskytujú aj listnaté lesy. V smrečinách sa vyskytujú ďalšie chránené druhy, ako sú chvostník (plavúň) jedľovitý, soldanelka maďarská, kortúza Matthiolova, rebrovka rôznolistá a horec luskáčovitý. Najteplejšie lokality podhorského stupňa v Malej Fatre zaberajú reliktné boriny. Rozšírené sú na strmých vápencových bralách Sokolia, Bobôt a Dier. Po floristickej stránke sú nesmierne bohaté. Vyskytujú sa v nich mnohé vzácne druhy rastlín, z chránených poniklec slovenský, medvedica lekárska, muchovník vajcovitý a klinček peristý. Nech Vás neprekvapí, ak niektoré z uvedených rastlín nájdete rásť aj inde, nielen v lese. Niektoré možno vidieť rásť aj na lesných čistinách a rúbaniskách, napríklad horec luskáčovitý, chvostník (plavúň) jedľovitý sa vyskytuje aj na skalách a v kosodrevine, na druhotných holiach nájdeme soldanelku maďarskú. Svedčí to o tom, že na týchto miestach bol v minulosti les, alebo sú vhodné podmienky pre existenciu týchto druhov aj mimo lesa. I keď táto skupina rastlín nebola do nedávnej doby zvlášť ohrozená, dnes situácia vyzerá ináč. V minulosti boli niektoré druhy zbierané najmä pre svoj atraktívny vzhľad, alebo boli využívané v ľudovom lekárstve.