Rozmanitosť biotopov a spoločenstiev na nich žijúcich je spôsobená rozmanitosťou podmienok na zemi. Rastliny a živočíchy boli schopné osídliť akúkoľvek plochu na zemskom povrchu, a naopak, i živé organizmy sa podieľajú aktívne na tvorbe týchto biotopov - vytvárajú pôdu, napomáhajú zvetrávaniu… Zemský povrch tak tvorí jeden kompaktný a pritom nesmierne rozmanitý celok, ktorý je hodný zachovať a chrániť i pre ďalšie generácie. Ochrana tejto rozmanitosti biotopov, čiže ochrana všetkých typov biotopov, nielen hospodársky či turisticky využiteľných, je dôležitá i kvôli ochrane druhovej. Záchrana ohrozenej rastliny či živočícha je možná len v prípade, že budeme chrániť aj miesto jej výskytu, teda jej biotop, ekosystém, v ktorom sa nachádza. A ochrana ekosystému predstavuje ochranu všetkýcch jeho zložiek - abiotických (materská hornina, pôda, voda, vzduch...) i biotických (rastliny a živočíchy). Nesmieme zabudnúť na dôležitosť oblastí a biotopov pre človeka nie zaujímavých a turisticky využiteľných - z hľadiska zachovania druhovej rozmanitosti a zachovania ekologickej rovnováhy planéty ako obrovskej krajiny s množstvom väzieb, procesov, závislostí sú rovnako dôležitou zložkou prostredia ako ostatné. Nezabudnime, že naše hospodárstvo i existencia samotná je závislá na funkčnosti a stabilite krajiny a všetkých v nej prebiehajúcich procesov.
Ochrana ekosystémov
Ekosystémy sú ohrozené:
- znečistením zložiek prostredia - vzduchu, vody, pôdy. Toto znečistenie priamo ohrozuje existenciu rastlín a nepriamo - cez potravu i existenciu živočíchov v ekosystéme
- zánikom prírodného prostredia a premenením na kultúrnu či priemyselnú krajinu - to je prípad napr. močiarov, zaplavovaných lúk, mnohých lesov, lúk a pasienkov, rašelinísk.....
- čiastočným premenením na kultúrnu krajinu - ekosystém síce čiastočne zostal zachovaný, ale vplyvom kultúrnej krajiny v jeho blízkosti a hlavne nedostatočnou plochou ekosystému, kde nie sú splnené nároky v ňom žijúcich organizmov, sa stáva nestabilným a zaniká
- zavlečením alebo výsadbou preň nepôvodného druhu rastliny či živočícha (odborný termín introdukcia)- celosvetovo známym príkladom je prenesenie králika do Austrálie, kde nemal prirodzeného nepriateľa a mohol sa neobmedzene množiť, a tak vypásol obrovské územia pasienkov, kde ohrozuje existenciu púvodného bylinožravca - kengury. U nás sa tak po krajine šíria nepôvodné druhy rastlín - napr. borovica čierna Pinus nigra, či reinutria japonská Reinutria japonica, ktorá už osídlila pásy krovín pozdĺž železničných trás a vytláča odtiaľ všetky pôvodné druhy. Zo živočíchov napr. rakúsky poddruh kamzíka vrchovského pomaly vytláča náš pôvodný tatranský poddruh.
- nadmerným turizmom - rušenie mláďat i dospelcov počas obdobia hniezdenia či výchovy mláďat, zberom rastlín a plodov, zošľapávaním pôdy - citlivé sú hlavne vysokohorské územia a ekosystémy strmších svahov
