1887Publica trabajos de tema histológico en las revistas valencianas "La Crónica Médica" y el "Boletín del Instituto Médico Valenciano". Por Real Orden, en virtud de un concurso de méritos se le confiere la Cátedra de Histología e Histoquimia normal y Anatomía Patológica de la Facultad de Medicina de Barcelona. Nace su quinta hija, Pilar Enriqueta.
1888Dado el volumen de trabajo, decide editar por su cuenta una publicación periódica, "Revista trimestral de Histología normal y patológica". El primer cuaderno aparece en mayo de este año. DESCUBRE LA ESTRUCTURA DEL SISTEMA NERVIOSO "TEORÍA NEURONAL". Cajal llamaría a este año "mi año cumbre, mi año de fortuna".1889Muere su hija Enriqueta. En octubre, asiste a un congreso médico anual en Berlín para demostrar sus descubrimientos. Entabla amistad con Kölliker, gracias al cual será conocido en el resto del mundo.
1890Nace la sexta hija, Pilar.1891Nace Luis, su séptimo y último hijo. Expone la Ley de polarización dinámica de las neuronas en el Congreso Médico de Valencia.
1892Por oposición, es nombrado Catedrático Numerario de Histología e Histoquimia normal y Anatomía Patológica de la Facultad de Medicina de la Universidad Central de Madrid. Construcción y organización de un laboratorio histológico dotado de todos los recursos técnicos.
1893Publica varios estudios científicos.
1894El 5 de marzo es nombrado Doctor Honoris Causa por la Universidad de Cambridge. El 8 de marzo pronuncia una conferencia en la Royal Society de Londres "Croonian Lecture".
1895Se le conceden premios y títulos en las mejores universidades del mundo.
1896Introduce en sus trabajos el método de Ehrlich.
1897Empieza a publicar el primer fascículo de su obra cumbre: "Textura del sistema nervioso del hombre y los vertebrados".
1898Muere su madre, Dª Antonia Cajal. Publica el segundo fascículo de "Textura del sistema nervioso...".
1899Nombrado Doctor Honoris Causa en la Universidad de Clark, Boston y Harvard. Tercer fascículo de "Textura del sistema nervioso...".
1900Se le otorga en el Congreso Internacional de Medicina de París el "Premio Moscú". Director del Instituto Nacional de Higiene Alfonso XII hasta 1920, le sucede su discípulo Francisco Tello. El Consejo de Ministros aprueba la creación del Laboratorio de Investigaciones Biológicas. Trabajará aquí durante 30 años. Es nombrado Consejero de Instrucción Pública. Cuarto fascículo de "Textura...".
1901Se crea el Laboratorio de Investigaciones Biológicas. Quinto fascículo de "Textura...". Publica la revista "Trabajos del Laboratorio de Investigaciones Biológicas". Sus alumnos organizan una fiesta en el Paraninfo de la Universidad de Madrid para celebrar su éxito. Publica "Recuerdos de mi vida: Mi infancia y juventud".1902Sexto fascículo de "Textura...". Publica su ensayo "La psicología de los artistas".
1903Investigaciones sobre la fisiología del sistema nervioso. Muere su padre..1904Junto al último fascículo, publica la obra completa "Textura del sistema nervioso del hombre y los vertebrados". Esta obra consta de 1.800 páginas y 887 grabados..1905Primeros trabajos sobre la degeneración y regeneración de los nervios. Publica "Cuentos de vacaciones". Recibe de la Real Academia de Berlín la MEDALLA DE ORO DE HELMHOLTZ, reconocimiento más prestigioso del momento y del que se sentía más orgulloso.
1906El 10 de diciembre RECIBE EL PREMIO NOBEL DE MEDICINA DE MANOS DEL REY OSCAR II DE SUECIA en la Real Academia de Música de Estocolmo, donde pronuncia una conferencia titulada "Estructura y conexiones de las neuronas". Comparte este premio con Camilo Golgi.
1907Se crea la J.A.E. (Junta para la Ampliación de Estudios e Investigaciones Científicas). Cajal es su presidente.
1909Fellow de la Royal Society.
1910Canalejas le nombra senador vitalicio.1911Muere su hijo Santiago. Publica 'Histologie du système nerveux de l'homme et des vertebrés', edición muy renovada de la versión de 1904.
1912Publica "La fotografía de los colores. Bases científicas y reglas prácticas". Por iniciativa de Nicolás Achúcarro, se crea en la Residencia de Estudiantes un laboratorio de anatomía microscópica. Publica "Estudios sobre la degeneración y regeneración del sistema nervioso" Tomo I.1914Publica "Estudios sobre la degeneración y regeneración del sistema nervioso". Tomo II.
1915Publica, junto con Domingo Sánchez, una extensa monografía bajo el título de "Contribución al conocimiento de los centros nerviosos de los insectos".
1916Fernando de Castro empieza a trabajar en el laboratorio.
1917Publica una versión corregida de "Recuerdos de mi vida: Historia de mi labor científica". 1918Publica "Manual técnico de Anatomía Patológica", junto a Francisco Tello.
1919Algunos de sus discípulos fundan el Instituto THIRF.1920Por Real Decreto se crea el Centro Nacional de Investigaciones Biológicas o Instituto Cajal. El Ministro de Instrucción Pública, Natalio Rivas, promovió junto con Alfonso XIII la creación de dicho instituto. Por iniciativa de Cajal, se crea en la Residencia de Estudiantes un Laboratorio de Histopatología del sistema nervioso, también llamado de Histología Normal y Patológica que, dirigido por Pío del Río Hortega, será en realidad una segregación del Laboratorio de Investigaciones Biológicas de Cajal.1921Escribe Charlas de Café.1922La Real Academia de las Ciencias le concede la Medalla Echegaray en sesión presidida por el rey Alfonso XIII. La Academia publicó el discurso de ingreso junto con una bibliografía de sus trabajos. Cajal amplió el discurso de ingreso y lo transformó en un libro titulado "Reglas y consejos sobre investigación científica. Los tónicos de la voluntad". Se jubila con 70 años. Estuvo impartiendo clases desde 1884 hasta 1922.
1923Tercera edición de Recuerdos de mi vida.1924Doctor Honoris Causa por la Sorbona de París.1925Enriqueta Lewy sustituye a Irene Falcón como secretaria de Cajal.1926Reconciliación con Pío del Río-Hortega. Castro se incorpora al laboratorio.1927Reforma su testamento.
1930El 23 de agosto muere su esposa Dª Silveria Fañanás. Cajal siguió viviendo con su hija Fé (viuda).
1931El Instituto Cajal continúa en obras. 1932Se inaugura el Instituto Cajal. Dimite de la Dirección del Instituto Cajal y de la Presidencia de la JAE. En ambos cargos le sucede Tello.1933El Laboratorio de Investigaciones Biológicas se traslada al Instituto Cajal. Publica su testamento científico: "Neuronismo o reticularismo", recopilación de todos los hechos y teorías que demuestran su teoría neuronal y refutan la teoría reticularista.1934Publica "El mundo visto a los 80 años. Impresiones de un arterioesclerótico". El 17 de Octubre muere D. SANTIAGO RAMÓN Y CAJAL.