Zvýšenie kyslosti pôdy zapríčiňuje zvýšené uvolňovanie hliníka, ktorý je pre väčšinu mikroorganizmov, ale hlavne pre nitrifikačné baktérie, veľmi škodlivý, čím sa ich množstvo musí znížiť. Na rozvoj mineralizačnej mikroflóry pôsobí priaznivo hlavne vápnenie pôdy a preto na kyslých rašelinových pôdach veľmi urýchli mineralizáciu nadbytočného množstva organických látok.
Kým v kyslých pôdach používame vápno na zmenšenie kyslosti, v zásaditých pôdach zase kyslosť zvyšujeme, a to hnojením elementárnou sírou. Princíp tohto hnojenia je následovný:
Do pôdy je pridaná elementárna síra, ktorá je sulfurikačnými mikroorganizmami okysličená až na H2SO4 ktorá značne zníži zásaditosť pôdy. Celkové množstvo mikroorganizmov sa po hnojení sírou zvýši. Toto zvýšenie nie je priamo zapríčinené ani zvýšením obsahu síranov, ani zvýšením kyslosti, ale hlavne tým, že zvýšením kyslosti sa zvyšuje dostupnosť H3PO4. Táto kyselina je totiž v zásaditých pôdach viazaná v nerozpustnej, a tým nedostupnej pôde. Tento spôsob zvyšovania kyslosti zásaditých pôd sa však z ekonomických dôvodov- zatiaľ by bol veľmi drahý- nedá používať v širšom meradle.

BAKTERIÁLNE HNOJIVÁ
Mikroorganizmy majú v pôde veľkú úlohu pri nahromaďovaní dusíka, pri humifikácii a pri mineralizácii. . Niektoré dôležité mikroorganizmy sa však v určitých pôdach z rozličných príčin nevyskytujú. Rozličné skupiny mikroorganizmov pridávame do pôdy vo forme bakteriálnych hnojív. Najčastejšie použivanými bakter. hnojivami sú: nitragín (u nás nitrazón) , azotobakterín, fosforobakterín, a bakteriálne hnojivo AMB. Okrem toho môžeme sem zaradiť aj mykorizáciu.
Nitragín
- používa sa na bakterizáciu semien motýľokvetých rastlín a obsahuje hľúzkové baktérie. Bakterizácia semien má za následok zvýšenie tvorby hľúzok, zvýšenie fixácie vzdušného dusíka a zvýšenie výnosu motýľokvetých rastlín. Ak spolu s nitragínom použijeme aj iný spôsob hnojenia, napr. vápnenie kyslých pôd, účinnosť nitragínu sa zvýši. Azotobakterín
- je to bakteriálne hnojivo, ktoré obsahuje azotobaktera, ktorý viaže vzdušný dusík. Používa sa na bakterizáciu semien. Potom sa rozvíja v blízkosti koreňového systému rastlín, fixuje vzdušný dusík a tak zlepšuje dusíkatú výživu rastlín. Po použití tohto hnojiva sa výnosy zvyšia približne o 10-20 %. Účinnosť azotobakterínu sa zvyšuje súčastným hnojením minerálnymi hnojivami, hlavne fosforečnými.

Fosforobakterín
- toto bakteriálne hnojivo obsahuje baktérie , ktoré zlepšujú výživu rastlín. Tie totiž veľmi často trpia nedostatkom fosforu, i keď tohto prvku je pôdach obyčajne dostatočné množstvo. Používa sa na bakterizáciu semien a výnosy plodín sa môžu zvýšiť o 10-15%.