Zisťovacie konanie taktiež začína predložením Zámeru a končí vydaním rozhodnutia, v ktorom Ministerstvo životného prostredia SR rozhodne, či sa činnosť bude, alebo nebude posudzovať podľa zákona. V prípade, že sa činnosť nebude posudzovať podľa zákona, nasleduje povoľovací proces podľa osobitných predpisov.

V prípade, keď Ministerstvo životného prostredia SR rozhodne, že sa bude činnosť posudzovať podľa zákona, proces posudzovania pokračuje ako v povinnom hodnotení krokmi 2. až 6. t.j. 2. určenie rozsahu hodnotenia, 3. vypracovanie Správy o hodnotení, 4. pripomienkovanie a verejné prerokovanie Správy o hodnotení, 5. vypracovanie posudku, 6. vypracovanie záverečného stanoviska.

Zisťovacie konanie, na rozdiel od povinného hodnotenia, sa vykonáva podľa zákona č. 71/1967 Zb. o  správnom konaní.

Účastníci procesu posudzovania, ich práva a povinnosti

Procesu posudzovania sa zúčastňujú tieto subjekty:

Ministerstvo životného prostredia SR - (ďalej len "ministerstvo")

Navrhovateľ - fyzická alebo právnická osoba, ktorá navrhuje plánovanú činnosť

Príslušný orgán - rezortné ministerstvo, do ktorého kompetencie patrí plánovaná činnosť

Povoľujúci orgán - orgán štátnej správy príslušný na vydanie

rozhodnutia o povolení činnosti podľa osobitných predpisov

Dotknutý orgán - orgán štátnej správy, ktorého záväzný posudok, súhlas, stanovisko alebo vyjadrenie, vydávané podľa osobitných predpisov, podmieňujú povolenie činnosti

Dotknutá obec - obec, na katastrálnom území ktorej sa má plánovaná činnosť realizovať a obec, ktorej územie zasiahne vplyv činnosti