Riadi sa Organizačným a rokovacím poriadkom.
Komisia kontroluje nestrannosť výkonov spojených s realizáciou Programu, odporúča vytvoriť nové výrobkové skupiny, určuje postup pri tvorbe a revízii smerníc a odporúča ich na schválenie ministrovi ŽP SR, vypracúva postup pri hodnotení konkrétneho výrobku, technológie, služby, programu a akcie. Pripravuje pre ministra ŽP návrh rozhodnutia o udelení práva používať značku EVV. Zabezpečením čiastkových úloh môže Komisia poveriť účelovo vytvoriť skupinu odborníkov.
Organizačné zabezpečenie Programu donedávna realizovala Slovenská agentúra životného prostredia – Centrum environmentálneho hodnotenia výrobkov a technológií (SAŽP – CEHOVT), ktoré však v súčasnosti toto organizačné zabezpečenie nevykonáva. V súčasnosti to taktiež spadá pod Ministerstvo životného prostredia. To garantuje nezávislosť a neutralitu výkonu procesov:
· vedie kompletnú dokumentáciu o procese,
· organizuje vybavovanie žiadosti o udelenie značky,
· zabezpečuje prípravu technických správ a smerníc,
· vedie evidenciu expertov, odborných pracovísk a oponentov pre prípravu technických správ, smerníc a expertných posúdení,
· spolupracuje s expertmi, odbornými inštitúciami, autorizovanými a akreditovanými pracoviskami skúšobní a pod.,
· predkladá ministrovi a Komisii jedenkrát ročne správu o stave Programu vrátane finančného vyhodnotenia,
· na pokyn a na základe schválenia ministrom životného prostredia pripravuje podmienky na uzavretie zmluvy o poskytnutí práva používať značku EVV,
· zúčastňuje sa kontroly dodržiavania zmlúv o poskytnutí práva používať značku EVV a dáva návrhy na nápravné opatrenia.
Na výrobky, pre ktoré boli schválené smernice, výrobca, resp. dovozca posiela na Ministerstvo životného prostredia prihlášku na environmentálne hodnotenie. Výrobok, ktorému má byť udelené právo používať značku EVV, musí vyhovovať základným a špecifickým požiadavkám smernice. Závery hodnotiaceho konania a overovania súladu výrobkov s požiadavkami smernice je predkladané formou dôvodovej správy Komisii, ktorá svojim stanoviskom odporučí ministrovi ŽP udeliť alebo zamietnuť právo používať značku EVV. Náklady na posúdenie zhody výrobku so smernicou znáša žiadateľ.
Organizačne a vecne je Program koncipovaný tak, aby pri posudzovaní prihlásených výrobkov boli využiteľné orgány výkonu štátnej správy v zmysle platnosti príslušných zákonov, autorizované akreditované a notifikované skúšobne a certifikačné miesta v rámci Slovenského národného akreditačného systému alebo akreditačných orgánov Európskej akreditačnej politiky. Ďalej osvedčenie podľa zásad správnej laboratórnej praxe OCED, oprávnenia podľa Vyhlášky MŽP SR č. 111/1993 Z.z. v znení neskorších predpisov, Vyhlášky MŽP SR č. 52/4995 Z.z.