Premenou pevných a kvapalných toxických odpadov na plynné emisie spaľovne vlastne zväčšujú objem odpadov, pretože ho miesia so vzduchom a rozptyľujú znečistené látky do pôdy, vody a ovzdušia. Toxický popol a voda z pračiek dymových plynov zostávajú ako vedľajšie produkty, ktoré vyžadujú ďalšiu problematickú likvidáciu. Spaľovne fungujú ako chemický syntetizér. Pri teplotách v rozmedzí od 400 - 1.600 °C sa zložité organické molekuly rozpadajú na základné atómy. Avšak, ako sa spaliny pri svojej ceste dymovými potrubnými cestami a komínom ochladzujú , niektoré atómy sa opätovne zlučujú a vytvárajú nové, mnohokrát ešte nebezpečnejšie, často však vôbec nepoznané zlúčeniny. V snahe znížiť znečistenie ovzdušia v súčastnosti množstvo firiem vybavuje spaľovne zariadeniami na čistenie resp. obmedzovanie emisií. Tieto práčky plynu a filtre neutralizujú kyselinu a zachytávajú pevné častice skôr, ako sa dym dostane komínmi zo spaľovne. Vodné práčky plynu zachytávajú znečistenie premývaním plynu pri päte komína. Elektrostatické filtre využívajú k zachyteniu častice elektrického náboja.
Ale ani tie najdokonalejšie zariadenia zachytávajúce škodliviny nezabránia znečisteniu okolia, ale vhodnými opatreniami je možné tieto vplyvy vo veľkej miere eliminovať.