Chlór reaguje aj s vodnými organizmami: rybí pach vzniká pri styku chlóru s :Asterionella, Synedria, či zelenými riasami (Eudorina, Desmidium), reakciou chlóru s inými riasami či vyššími baktériami vznikajú pachy, označované ako trávnaté, zatuchlé alebo odporné, reakciou s fenolmi vzniká "nemocničníý" zápach atď.Uvedené pachové závady sú tým zretelnejšie, čím väčššie je nachlorované znečistenie a dávky chlóru i čím dlhšia je doba pôsobenia chlóru. Bolo dokázané, že při chlorácii pitnej vody z látok humínového typu,rias a niektorých dusíkatých organických zlúčenín vznikajú trihalometány( chloroform, brómdichlórmetán, bromoform).
Chloroform: sa považuje za mutagénnu a karcinogénnu látku
Vápnik,horčík:
Asi štvrtinu potrebných esenciálních minerálnych látok vo využiteľnej forme získava človek len vodou. Značné percento potrebného množstva Ca, Mg, Fe je sprostredkované vodou. Železo:
Obsah železa vyskytujúceho sa vo vode je hygienicky bezvýznamný. Ovplyvňuje však senzorické vlastnosti vody,hlavne chuť, farbu a zákal vody.

BAKTERIOLOGICKÉ KONTAMINANTY:
Z biologických požiadaviek je nutné venovať pozornosť výskytu patogénnych prvkov, červov, siníc a rias. Okrem toho, že produkty niektorých siníc a rias sú toxické, pôsobia negatívne aj na organoleptické vlastnosti vody a môžu byť prekurzory trihalogénmetánu, karcinogénnej látky, ktorá vzniká pri chlorácii takto kontaminovaných vôd. Zárodky infekčných a parazitárnych chorôb sa môžu do vody dostať živočišnými odpadmi. Preto je dôležité sledovať, či voda bola alebo nebola fekálne znečistená. V prípade fekálneho znečistenia sa dajú vo vode dokázať rôzne mikroorganizmy črevného traktu, ale aj organické a anorganické látky, ktoré sú obsiahnuté vo fekáliách, a v moči a produkty ich biochemických premien.

Najdôležitešsie ochorenia prenosné vodou a ich pôvodcovia
a) Vírusy
- enterovíry - detská obrna
- adenovíry - zápaly dýchaciích ciest, čriev a spojiviek
- picornavíry - infekčna žltačka
b) Baktérie
- Salmonella typhimurium - týfus
- Shigella sp.
- Vibrio cholerae - cholera
- Escherichra coli - gastroenteritída
- Leptospira ictera - leptospiróza
- Mycobachteria tuberculosis - TBC
- Legionella pneumophila - legionárska choroba
c) Prvoky
- meňavka Entamoeba hystolica - amébová dyzentéria
- meňavka Nolglaria gruberi - amebická meningolacefalitída
- bičíkovec Lamblia intestinalis - chronický črevný katar
d) Červy
- vajíčka škrkaviek, pásomníc - parazitické ochorenia.

Nález zárodkov psychrofilných mikroorganizmov indikuje organické znečistenie,ale aj vystihuje celkové bakteriálne znečistenie vody.