Podnebie Alžírska je rôznorodé. Severná oblasť má subtropické stredomorské podnebie. Suché, veľmi teplé letá sa striedajú s miernou zimou. Priemerné ročná teplota tejto oblasti je 18 – 20oC, v Orane je najchladnejší mesiac január 12,2oC a najteplejší august 25,5oC. Hlavné obdobie zrážok je od novembra do marca, ročné množstvo je rozdielne v jednotlivých krajoch a pohybuje sa od 200 – 1050 mm. V zime padá vo vyšších polohách sneh. Celé južné Alžírsko –
Sahara, má typické púštne podnebie, kontinentálne. Priemerná ročná teplota dosahuje 23 – 28oC. V Reggane je najteplejším mesiacom júl s 38oC a najchladnejším je január s 14,7oC. Podnebie sa vyznačuje veľkými teplotnými výkyvmi medzi dňom a nocou. Zrážky na Sahare klesajú pod 100 mm. Vodstvo
Severné Alžírsko má riedku riečnu sieť. Rieky pramenia v horách Atlasu a ústia väčšinou do Stredozemného mora. Majú veľké kolísavé vodné stavy. Využívajú sa na zavlažovanie a k splavovaniu. Najväčšou riekou je Oued Chéliff, s dĺžkou takmer 700 km, s povodím 35 000 km2. Najväčšia priehrada je Iril – Emda na Oued Agrioune, ktorá umožňuje zavlažovať 200 000 ha pôdy. Alžírsko má viac ako 200 termálnych prameňov. K najznámejším patria
Hamman Bou Hanifia, Hamman Melouane a Hamman Meskoutine s najteplejším prameňom 98oC.
Väčšina Alžírska patrí k bezodtokovým oblastiam. K najväčším patrí Chott el Melrhir v preliačine (6 700km2), ďalej Chott el Chergui (2 000 km2), Sebkra Mekerrhane, Sebkra Azrel – Matti, Chott el Hodna, Sebkra de Timimoun. Najväčší význam v púštnych oblastiach majú podzemné artézske studne, umožňujúce vo veľkých oázach život v tejto púšti.