Nitra leží na 48 18 severnej šírky a 18 14 východnej zemepisnej dĺžky. Jeho stred tvorí poriečna nížina, ktorá leží v 140 m.n.m. Nitrianske lúky boli vždy mokré, čo možno badať aj dnes a spodná voda pravidelne vyrážala na povrch. Tieto oblasti boli rajom čajky obyčajnej (vanellus vanellus) a bociana bieleho (ciconia ciconia). Poriečna nížina je dlhodobým produktom geologickej činnosti rieky Nitry vo štvrťohorách. Miestami má vo svojom podloží hrubé vrstvy štrkopieskov, ktoré sa v južnom extraviláne aj ťažia. Aj treťohorné jemné piesky sa nachádzajú v niekoľkých lokalitách. Hrubé piesky však vznikli zvetraním prítomného plutonitu, ako to viedieť v zoborských vinohradoch. Viate pôdy sa vyskytujú vždy koncom bezsnehovej zimy alebo na začiatku bezsnehovej jari. Geologicky najstaršou časťou Nitry a jej okolia sú Zoborské vrch ako najjužnejšie výbežky Tribečského pohoria. Ich južné svahy sú organickou časťou Nitry.

Zoborské vrchy pokračujú za zlomom západným smerom Hradom, Šibeničným vrchom, Kalváriou a Katrušou, ktoré sú vápencového pôvodu. Tribečské pohorie patrí k centrálnym Karpatom. Petrograficky pozostáva prevažne z plutonitov a metamorfitov. V povrchových horizontoch má hojné triasové kremence a druhohorné vápence. Nachádzajú sa tu malé povrchové jaskyne so slabou krasovou formou, kvôli nedostatku prúdiacej povrchovej vody, ktorá by modelovala tunajšie horniny. Zobor má dve časti, prednú nižšiu , kremencovú (555 m.n.m.) a zadnú vyššiu, vápencovú. Posledným súvislým výbežkom zoborského hrebeňa je Lupka (248,7 m.n.m.). Na západnom svahu je horninové zloženie prevažne vápencové a na východnom prevažne kremencové.

Nitra je veľmi bohatá na rastlinný kryt. Všade sú flóristické biotypy, no najviac v zoborskej oblasti. Lesná flóra sa skladá zo skalnatotrávnatých alebo trávnato-kernatými ostrovčekmi, oplývajúcimi teplomilnými druhmi, ktoré tu našli vhodné podmienky. Stretávame sa s nimi najmä v štátnych prírodných rezerváciách Lupka a Žibrica. Z najznámejších rastlín sa tu nachádzajú: hlaváčik jarný , kosatec nízky , tatrica skalná, šalvia habešská. Pestrosť, bohatstvo a krása prírody nitrianskej oblasti si zaslúžili, aby jej bola venovaná pozornosť a starostlivá ochrana a aby zostala neporušená pre obdiv ďalších generácií.