Súčasťou okresu je Vojenský útvar Záhorie.
Z ložísk nerastných surovín sú najvýznamnejšie ložiská zemného plynu, ropy a gazolínu v lokalitách Gajary, Jakubov, Suchohrad, Vysoká pri Morave, Studienka a Závod, ktoré sprevádzajú aj termálne vody. Značný význam pre stavebníctvo tiež majú ložiská štrkopieskov v lokalitách Vysoká pri Morave a Malé Leváre. V katastri obce Rohožník, Pernek a Borinka sa nachádzajú kvalitné ložiská vápenca, ktoré sa využívajú na výrobu stavebných hmôt, hlavne v obci Rohožník / Hirocem a.s. Rohožník /. Ťažba stavebného kameňa sa realizuje v lomoch v Sološnici a v Plaveckom Petri. Viate piesky / zlievarenské piesky / v lokalitách Plavecký Štvnok a Lozorno sa doposial' priemyselne nevyužívajú. V záujmových územiach obcí Láb a Gajary sú vybudované vo vyťažených ropoplanových ložiskách podzemné zásobníky dovážaného zemného plynu, ktoré vyrovnávajú nerovnosti v spotrebe zemného plynu počas celého roka. Uvedený spôsob uskladnenia zemného plynu sa javí ako najvýhodnejší pri využití vhodných geologických pomerov vyťažených starých ložísk.



VODA

Hydrogeologické pomery:

Kvartérne piesky a štrky nivných území a štrkopiesky význačnejších terás a náplavových kuželov sa vyznačujú pórovou priepustnosťou dobrou až veľmi dobrou.
Pre d'alšie pokryvné štvrťohorné útvary - viate piesky a duny je charakteristické taktiež priepustnosť pórová a to slabá až dobrá. Mladšie neogénne súvrstvie ílov, slieňov a pieskov, prekryté sprašou sa vyznačujú pórovou priepustnosťou dobrou až slabou. Na tieto sedimenty sú viazané i artézske vody s negatívnou hladinou/okolie Malaciek/.
Pre staršie neogénne súvrstvie - íly, sliene, piesky a pieskovce je charakteristická priepustnosť pórová a puklinová/slabá/.Hladina podzemmej vody a štvrťohorných pokryvných útvarov/piesčité štrky zväčša s hlinitým pokryvom/ sa pohybujú od 0-2-5 m p. t., sedimenty sú málo zvodnené.
Hĺbka hladiny podzemnej vody vo viatych pieskoch, ktoré sú stredne zvodnené, kolíše od 0-5 m p. t.

Hydrologické pomery sú dané najmä hydrologickými a klimatickými podmienkami. Malacký okres patrí do povodia rieky Moravy. Morava má v priebehu roka značne nevyrovnané prietoky. Priemerný ročný prietok v profile nad Malinou je 1 16 m3/s. Prítoky na území sú Rudava a Malina. Prietoky týchto tokov sú v priebehu roka nevyrovnané a v dlhšom časovom rozpoložení v roku úzke.