Až do výšky 1500 m rastú husté dažďové pralesy, ktoré pokrývajú väčšinu plochy Kalimantanu, Sumatry a Západného Irianu. Rastú v nich obrovské fikusy a chlebovníky i stromové paprade. Bohatstvo druhou patrí k najväčším na svete (celkom sa tu vyskytuje asi 30 000 rastlinných druhov, z toho 4000 tvoria stromy). V horách rastú ihličnaté lesy, tak isto ako porasty dubov, gaštanov a vavrínov. K východu prevládajú monzúnové lesy s teakom a na Malých Sundách savana.
Živočíšstvo patrí k indomalajzskej oblasti, ale zahrňuje i rad unikátnych druhov. Vyskytuje sa tu 1480 druhov vtákov (16% z celkového počtu druhov na svete), z ktorých 370 je možné nájsť len v tejto oblasti. Z 500 druhov cicavcov je 100 unikátnych. Na ostrovčeku Komodo žije najväčší mäsožravý jašter na svete – varan komodský, dlhý aj cez tri metre. Typickým predstaviteľom fauny na Borneu a Sumatre je orangutan. Na Sumatre i Jáve žije tiger. Obrovskou rozmanitosťou vynikajú motýle. Vo východných oblastiach, hlavne na Novej Guineji, dominujú austrálske druhy.


Spoločnosť

Indonézia je konglomerátom nielen mnohých ostrovov, ale aj národov, etnických skupín, často s veľmi rozdielnou históriou.
Dejiny
Indonézia patrí k najskôr osídleným oblastiam na svete. Pred viac než 500 000 rokmi tu žil človek Jávanský (Homo erectus). Predkovia väčšiny indonézskych obyvateľov prichádzali pravdepodobne z Ázie od roku 1000 p. n. l. Od začiatku nášho letopočtu prenikajú na ostrovy indický kolonosti a obchodníci a šíria tam hinduizmus a neskôr aj budhizmus. V 2. – 7. storočí vznikli na Jáve a Sumatre prvé štátne útvary. V 7. storočí bola celá ostrovná oblasť aj s okolím ovládnutá budhistyckým kráľovstvom Šrívidžaja. Bola založená univerzita v Palembangu a vybudovaný Borobudur (750 – 850). Došlo k rozkvetu literatúry, umenia i remesiel.
Od 9. do 12. storočia región ovládli Saleiderskí princovia. Na ich vládu naviazala Mandžapahitská ríša na Jáve, ktorá svojho vrcholu dosiahla v polovici 14. storočia, ale začiatkom 16. storočia sa rozpadla. Úpadok Mandžapahítu súvisel s prenikaním islamu, ktorý šírili arabskí obchodníci.
Začiatkom 16. storočia sa na Molukách, zvaných Ostrovy korenia, usadili Portugalci. Roku 1608 flotila Holandskej východoindickej spoločnosti donútila Portugalcov ku kapituláci a Holandsko postupne hospodársky ovládlo Jávu (roku 1621 bola založená Batávia), Sumatru a Muluky. Roku 1811 obsadili holandské kolónie Briti, ale Viedenskou dohodou ich v rokoch 1814 – 1815 Holandsku vrátili.