Vo vodách žije morská huba sklenná. Vyhubená je už prekrásna vydra morská – Enhydra marina. Národné parky

J
aponci sú známi svojím vzťahom k prírode, ktorú si odpradávna vážia a uctievajú. Stala sa silným inšpirujúcim zdrojom pre japonskú literatúru, umenie a je trvalou súčasťou národnej kultúry. Vyjadrením toho je aj zákon o chránených vzácnych prírodných oblastiach a rezerváciách, ktorého cieľom je zachovať prírodu neporušenú a chrániť ju pred zhubnými vplyvmi industrializácie. Podľa tohto zákona sa od roku 1957 postupne zriadilo 27 rozsiahlych národných parkov, 47 štátnych rezervácii a asi 290 prefektúrnych chránených oblastí. Národné parky a rezervácie zaberajú vyše 5 % celkovej rozlohy krajiny.
Na Hokkaide bolo zriadených päť národných parkov: Riširi-Rebun-Sarobecu, Širetoko, Akan, Daisecu a Šikocu-Toja. Pre ich scenériu sú charakteristické vulkanické pohoria, z ktorých vyvierajú početné termálne pramene, husté lesy, horské jazerá a močiare.
Na severnom Honšú v oblasti jazera Towoda a južnejšie položenej vysočiny Hačimantai je národný park Towoda-Hačimantai. Členité pobrežie Tichého oceánu s mnohými polostrovmi a hlbokými zálivmi tvorí národný park Rikučú. Národný park Bandai-Asahi pozostáva zo štyroch častí: okolia jazera Inawaširo, pohoria Bandai-Asahi, hory Iide a pohoria Asahi-Gassan. Najnavštevovanejší národný park je Nikkó. Národný park Džóšin tvoria náhorné plošiny, vysočiny a dve vulkanické pohoria, dosahujúce výšku 2 000 m n. m., so známymi aktívnymi vulkánmi Asama a Širane. Pohoria, údolia a lesy na sever od Tokia tvoria národný park Čičibu-Tama.
Bohatá subtropická vegetácia malebných ostrovov s prekrásnou scenériou pobrežia je charakteristická pre národný park Ogasawara na Boninských ostrovoch, ktoré administratívne patria k Tokiu, i keď sú od neho vzdialené 800 km. Súčasťou národného parku Fudži-Hakone-Izu je hora Fudži s piatimi jazerami, výletné a kúpeľné stredisko Hakone a časť polostrova Izu a sedem ostrovov Izu. Národný park Čúbu sangaku je nazývaný aj národným parkom Japonských Álp. S jeho vyše trojtisícovými vrcholmi je centrom vysokohorskej turistiky. Oblasť južných Japonských Álp patrí k národnému parku Minami Arupusu. Centrom národného parku Hakusan na východnom pobreží Japonského mora je hora Haku vysoká 2 702 m. Na pobreží Tichého oceánu na polostrove Šima sa nachádza národný park Ise-Šima, ktorý je povestný veľkým počtom mysov. Pestujú sa tu umelé perly.