Dej knihy sa odohráva v malebnom kraji švajčiarskych Álp, kde privádza Heidu úplnú „sirotu“ jej teta Brigita, aby ju prenechala na starosť Heidinmu starému otcovi. Dievčatko strávi u starého otca tri roky, za ten čas sa zoznámi s dedinou Dorfli a jej obyvateľmi. Pomáha pastierovi Petrovi pri pasení kozičiek a ovečiek. Okolitá príroda jej prirastie k srdiečku a ťažko sa jej odchádza s Brigitou z Dorfli do Frankfurtu robiť spoločníčku Kláre Sesemannovej. Heidi si ťažko zvyká na život v meste, iba priateľstvo Kláry jej pomáha zahnať clivotu za domovom.

Na druhej strane sa u Kláry naučí čítať, písať, počítať a dozvie sa ďalekých krajinách. Heidi zasa rozpráva Kláre o rastlinách, ktoré rastú u nich. Nakoniec ju clivota premôže a doktor jej nariadi návrat domov k deduškovi. Dievčatá sa rozlúčia, ale sľúbia si, že Klára navštívi Heidi vo Švajčiarsku. Klára naozaj príde, pobyt v horách jej prospeje až tak, že sa jej vráti zdravie a opäť začne chodiť. Z vďačnosti Klárina stará mama Sessemannová pozve našu kamarátku Heidi na prázdniny do Francúzska. Avšak tá sa rada opäť vracia domov, kde prežíva ďalšie príhody a dobrodružstvá. Heidi zachráni zranenú sučku a jej päť šteniatok, a vychová z nich lavínových psov, tým dokáže svoju lásku nielen k ľuďom, ale aj k zvieratám.