Proti tomu sa zdvihol prudký odpor univerzity. Na čele stál Hus spolu so siedmymi účastníkmi, ktorí podali pápežskému stolcu odvolanie proti arcibiskupovmu príkazu odovzdať a spáliť knihy, veľmi draho získané. Zároveň v kázni v Betlehemskej kaplnke 22. júna 1410 Hus protestoval proti zákazu kázať v kaplnkách a vyhlásil, „že chce raději poslouchat Boha než lidi a že proto se z nespravodlivého příkazu odvoláva nejprve k Bohu, který uděluje autoritu ke kázání, a potom i k apoštolskému stolci, který má vyšší autoritu, než domácí preláti.“
Týmto odvolaním sa k pápežovmu stolcu sa vlastne Hus dostáva pred súd kúrie, čím je zahájený jeho proces. 2. Husov proces pred kúriou
16. júla 1410 dal arcibiskup spáliť odovzdané Wyclifove knihy (18 jeho spisov - medzi nimi i také, ktoré sa nedotýkali viery, ale logiky, fyziky, matematiky a pod.). Toto však nezabránilo ďalšiemu šíreniu Wyclifovho učenia. V Prahe sa medzi ľudom zdvihla vlna prudkého odporu. Po spálení kníh arcibiskup odišiel na svoj hrad v Roudnici, odkiaľ 18. júla 1410 vyhlásil proti Husovi a ostatným, ktorí sa odvolali, kliatbu. Sám arcibiskup však nemal silu túto kliatbu presadiť. Odpor pražských obyvateľov bol taký silný, že farári sa neodvážili kliatbu ani vyhlasovať. Zakrátko vystúpili na obhajobu Wyclifových spisov aj majstri univerzity a sám kráľ Václav nariadil arcibiskupovi, aby univerzite nahradil škodu za zničené knihy.
Sporné Husove záležitosti sa presunuli pred súd kúrie. Pápež zveril vyšetrovanie a rozhodnutie kardinálovi Odonovi z Colonny, ktorý začal apel rýchlo prejednávať. Kardinál si vyžiadal mienku bolonských teológov o oprávnenosti spáliť knihy. Ich mienka bola: knihy nemali byť spálené, pretože takto bola urazená oxfordská univerzita (ktorej členom bol Wyclif) a aj pražská univerzita. Tým však nie je povedané, že Wyclifovo učenie je nezávadné. Schôdza teológov teda potvrdila oprávnenosť Husovho odvolania. Kardinál Colonna však nemal povinnosť riadiť sa touto mienkou. Čoskoro do kúrie prišli na Husa Zbyňkove žaloby pre hlásanie bludnej náuky a poburujúce kázne. Zbynek žiadal ustanoviť sudcu, ktorý by bez ohľadu na apel stíhal odporcov a predvolal Husa na súd. Túto žiadosť sprevádzali aj hmotné dary pápežovi, kardinálom a prokurátorom. Colonna stanovil, že apelácia sa nepripúšťa a predvolal Husa na súd.