Podozrieval ho, že ho ešte nenaučil všetko čo vie a utajil mu tajomstvo čiernej mágie. Mocenigovci patrili k mocným patricijským rodom a udanie takéhoto šľachtica, nebolo možne hodiť pod stôl ako výplod osobnej pomsty. Vyšetrovanie G. Bruna malo v Benátkach od začiatku politické pozadie. Pri výsluchoch sľúbil, že svoj život, ak mu bude darovaný zmení, aby príkladným životom vyvážil pohoršenie, ktoré spôsobil. Toto vyslovil pod hrozbou, lebo sa bál, že ak začne tribunál skúmať celú jeho minulosť, a nie len súbor Mocenigových obvinení bude stratený. Rím žiadal aby mu bol Bruno vydaný. Nebolo zvykom aby Benátky vydali do Ríma muža, ktorý bol súdení pre kacírstvo. Senát a Dóža žiadosť Ríma odmietli. Situácia sa však zmenila keď sa do všetkého vložil sám pápež Klement III. Medzi Benátkami a Rímom platila nepísaná dohoda vydávať utekajúcich mníchov.

Giordano takýmto utečencom bol a preto bol napokon Rímu vydaný. Sväté ofícium začalo skúmať všetky spisy a knihy, ktoré G. Bruno vydal. Vlastný súd sa začal až po šiestich rokoch príprav. Bol predvolaný a bolo mu oznámené, že jeho názory boli uznané za kacírske a odporujúce katolíckej cirkvi. Bruno však odmietol odvolať svoje názory a vrátiť sa do lona cirkvi. Nakoniec rozhodol sám pápež Klement VIII., vinník má byť odsúdený. G. Bruno bol stále nezlomný a pri čítaní rozsudku vyhlásil: „Vynášate svoj rozsudok nado mnou s väčším strachom, ako ja ho počúvam“. Ani pred smrťou neprejavil záujem a ochotu zmieriť sa s cirkvou. Aj keď bol posledné desaťročie izolovaný od sveta nebol zabudnutý. Mnohí sa i po jeho smrti k nemu vracali a hľadali v jeho prácach inšpiráciu. 5.2. Galileo Galilei
Dialóg o dvoch najväčších systémoch sveta: ptolemájovskom a koperníkovskom, autorom tohto spisu je matematik Galileo Galilei. Schválenie rukopisu do tlače vykonal rímsky pápežský cenzor Riccardi.

O tri mesiace neskôr dostali kníhkupci zákaz ďalšieho predaja spisu. Spis bol predaný inkvizícií a vzápätí bol Galileo, 70 ročný starec, predvolaný. Mohol utiecť, ale on sa rozhodol bez váhania cestovať do Ríma. Bol obvinení z opakovanej herézy a
len odvolanie ho mohlo zachrániť pred smrťou a tak sa aj stalo. Galileo bol na rozdiel od Bruna oddaným synom cirkvi, veriacim katolíkom, ktorý bol

oddaný pápežskej autorite. Keď sa na základe vlastných výpočtov presvedčil o pravdivosti heliocentrického systému, rozhodol sa presvedčiť cirkev o tom, ako užitočné by bolo, keby cirkev uznala nové poznatky a uviedla ich v súlade s pravdou Biblie.