sa Prusko oficiálne stalo spojencom Francúzska, no tajne bolo spojené aj s Ruskom.21.-23.apríla Anglicko vyhlásilo Prusku vojnu, lebo uzavrelo všetky prístavy pre anglické lode.Tajná dohoda z 20.marca 1806 - tajné spojenectvo Pruska a Ruska.
9.augusta sa Pruská armáda vzchopila a odmietla podmienky Francúzska a žiada, aby Francúzsko stiahlo svoje vojská za Rýn.6.októbra 1806 Napoleon vyhlásil Prusku vojnu.14.októbra pri Jene aAuerstadte Prusi utrpeli porážku, kráľ ušiel.21.novembra 1806 Napoleon podpísal v Berlíne dekréty o Kontinentálnej blokáde.Napoleon ukladá Fridrichovi Wilhelmovi čoraz vyššie dane za mier, a preto sa chce spojiť s Ruskom.8.februára 1807 bitka pri Jílove - Rusi s Francúzmi, no nikto nevedel, kto je víťaz.Napoleon chce uzavrieť mierovú zmluvu s Ruskom, no Prusko a Rusko 25.apríla podpísalo v Bartensteine novú dohodu o spojenectve, takže ponuku Francuzska odmietlo.14.júna 1807 boj pri Friedlande sa skončil porážkou ruskej armády.25.júna v Tylži podpísaný mier - Francúzsko a Rusko sa spojilo.9.júla aj s Pruskom.V tom čase sa Rakúsko opať pripravilo na vojnu proti Francúzom, ale v priebehu 5 dní boli donútení na ústup.22.apríla pri Eckmuhle ich Francúzi porazili.No rakúsky ľud ešte viac vzplanul.Medzi Aspernom a Esslingom Napoleon zaútočil, no napriek všetkému úsiliu sa táto bitka skončila porážkou Napoleona.5.a 6.júla boj pri Wagrame skončil víťazstvom Francúzskych vojsk, Rakúšania museli ustúpiť.14.októbra Schonbrunská dohoda - Rakúsko stratilo juhovýchodné a výchdné provincie.

Ešte v roku 1806 Napoleon vyhlásil kontinentálnu blokádu - zákaz dovozu anglických výrobkov, no k blokáde sa nepridalo Portugalsko, porušovalo ju Španielsko a r.1810 ju prestalo rešpektovať aj Rusko.Preto r.1807 Napoleon obsadil Portugalsko, a nakoniec úplne bez zbraní získal aj Španielsko a 6.júna 1808 vyhlásil za špsanielskeho kráľa Jozefa Bonaparta.No nepodarilo sa mu úplne si pomaniť túto krajinu a na odpor proti intervencii sa postavil celý národ podporovný Anglickom a Portugalskom.Prepukla španielska partizánska vojna guerilla, v ktorej Napoleonova Veľká armáda postupne úplne zlyhala.14.júla v Bailéne francúzska armáda kapitulovala.30.augusta kapitulovala aj v Portugalsku, kde sa vylodili anglické jednotky pod velením gen.Artura Wellesleya.Spojené sily Británie, Španielska a Portugalska pod jeho velením dosiahli nad Francúzmi rozhodujúce víťazstvá.Boje na Pyrenejskom polostrove pokračovali do r.1813, keď v bitke pri Vittorii zvíťazili nad Francúzmi a donútili ich ustúpiť.

Keď cár Alexander r.1810 odmietol dodržiavať Kontinentálnu blokádu, Napoleon začal s prípravami na výpravu proti rusku.Od r.1811 začína vojna medzi Francúzskom a bývalým spojencom Ruskom.24.júna 1812 vstúpila 600 tisícová armáda cez Nemen na ruské územie.7.septembra sa odhrala krvavá bitka pri Borodine, morálne bolo víťazom Rusko, ale keďže nezískalo dostatočnú prevahu museli opustiť Moskvu.14.septembra vošli francúzske vojská do Moskvy, ktorá bola úplne prázdna.24.októbra v bitke pod múrmi Malojaroslavca sa francúzska Veľká armáda úplne rozpadla.18.decembra sa Napoleon vrátil do Paríža, aby zorganizoval novú armádu.Na začiatku r.1813 sa mu podarilo utvoriť novú 500 tisícovú armádu, no teraz už musel bojovať proti celej Európe, všade sa ľu búril proti Napoleonovi.2.mája pri Lutzene prusko utrpelo porážku a Bonaparte obsadil Sasko.14. a 15.augusta pri Dražďanoch Francúzi vyhrali napriek presile spojeneckých vojsk.Rozhodujúca 3-dňová bitka pri Lipsku - 16.-18.októbra 1813.Napoleonove vojská boli rozprášené.Celé Nemecko sa teraz postavilo proti Francúzom, aj Taliani a Španieli vyhnali Francúzov.Začiatkom r.1814 vstúpili koaličné vojská na územie Francúzska, aj napreik niekoľkým víťazstvám nedokázal zastaviť ich postup a 31.marca 1814 vstúpili spojenecké armády do Paríža.Napoleon 6.apríla podpísal úplnú abdikáciu a odišiel na ostrov Elba.2.apríla zvolili za dočasnú hlavu Francúzskej vlády Talleyranda.1.marca 1815 sa Napoleon so svojimi najbližšími a najvernejšími vylodil na južnom pobreží francúzskeho kráľovstva.Ľud vítal Napoleona, pripojila sa k nemu aj armáda, generáli, ktorí s nim bojovali.Napoleon sa chce so všetkými zmieriť, ale nik to neprijal, koalícia vyhlásila vojnu.Napoleon sa rozhodol čeliť týmto vojskám.15.júna Farncúzska armáda prešla Sambru pri Charleroi a zajvila sa tam, kde ju nik nečakal16.júna zaútočil na Angličanov pri Quatre-Bras a porazil ich.18.júna dal Napoleon rozkaz zaútočiť na Wellingtonovu armádu pri Waterloo.Francúzi už vyhrávali, keď sa na pravom krídle ukázala rýchlo pohybujúca sa armáda, Napoleon si myslel, že mu prichádzajú posily, no nebolo to tak.Táto armáda začala útočiť na Francúzske vojská, ktoré sa v panike dali na útek.Napoleonova armáda bola rozdrvená.Francúzsky ľud aj napriek tomu stále podporoval Napoleona.Nakoniec podpísal abdikáciu v prospech svojho syna Napoleona II.22.júna.a 15.júla 1815 bol doživotne intervenovaný na ostrove sv.Heleny.