Od roku 1942 (porážka Nemecka pri Stalingrade) sa formuje domáci odboj, ktorý sa snaží skoordinovať so zahraničným odbojom. Domáci odboj bol namierený predovšetkým proti totalitnému režimu a spojenectvu s nacistickým Nemeckom. Roku 1942 sa začali na Slovensku tvoriť prvé ozbrojené partizánske skupiny.
Rôzne smery odboja nemohli dlho nájsť spoločnú reč.
- DEMOKRATICKÝ, OBČIANSKY odboj sledoval obnovenie Československej republiky.
- KOMUNISTICKÝ odboj chcel vytvoriť "sovietske Slovensko", ktoré sa malo stať súčasťou Sovietskeho zväzu.
Po dlhých sporoch a nezhodách sa oba odboje spojili a v roku 1943 tajne vytvorili najvyšší odbojový orgán - Slovenskú národnú radu (SNR), ktorej sídlo bolo v Banskej Bystrici.
Koordinácia odboja od 1943:
a) december 1943 - E. Beneš podpísal zmluvu medzi ČSR a ZSSR o priateľstve a spolupráci;
b) Vianočná dohoda - dohoda medzi zástupcami občianskeho a komunistického odboja - dohodli sa, že cieľom odboja bude obnovenie ČSR.