12.12.vznikla na Slovensku nová vláda pod vedením Milana Čiča.
V programovom vyhlásení novej vlády sa hovorilo o prechode Československa k parlamentnej demokracii a k trhovému hospodárstvu, žiadalo sa zrušenie Varšavskej zmluvy a odchod sovietskych okupačných vojsk z Československa. Túto fázu zavŕšilo zvolenie Alexandra Dubčeka za predsedu Federálneho zhromaždenia (28.12.) a 29.12. Václava Havla za prezidenta. Neklamným úspechom nežnej revolúcie bolo aj to, že staré štruktúry komunistov sa začali reformovať a mimoriadny zjazd 21.12.odsúdil vojenskú okupáciu roku 1968 a vylúčili najexponovanejších konzervatívcov. Na čelo KSČ sa dostal Ladislav Adamec, no rozklad strany pokračoval ďalej. Zanikli alebo sa pretransformovali aj ostatné spoločenské organizácie na čele s Revolučným odborovým hnutím (ROH). Z komunistických špičiek bol postavený pred súd a na štyri roky väzenia odsúdený iba predseda pražskej straníckej organizácie Miroslav Štěpán za zneužitie právomocí verejného činiteľa 17.11.1989.
Počas návštevy predsedu vlády Čalfu a ministra zahraničných vecí Dienstbiera v Moskve v decembri 1989 začali československí predstavitelia rokovať o stiahnutí sovietskych vojsk z Československa. Rokovania sa uskutočnili 27.februára 1990 počas návštevy prezidenta Havla v Moskve. Havel a Gorbačov dospeli k záveru, že zmluva o priateľstve a spolupráci sa nepredĺži, takže jej trvanie predsa ostalo obmedzené na 20 rokov. Obaja prezidenti sa dohodli, že sovietske vojenské sily opustia do polovice roka 1991 Československo, čo sa aj v skutočnosti udialo. 9.4.1990 sa po prvýkrát stretli na najvyššej úrovni delegácie Československa, Maďarska a Poľska, aby sa o rok neskôr vo februári 1991 na stretnutí v maďarskom Visegráde vytvorili zoskupenie s cieľom kooperovať svoju politiku, aby dosiahli členstvo v Európskej únii. Proces desovietizácie sa ukončil zrušením Varšavskej zmluvy 1.7.1991. Nový zahraničnopolitický kurz Československa sa čoskoro odrazil aj v prominentných návštevách (Francois Mitterand a Margaret Thatcherová v septembri 1990, George Bush v novembri 1990). Ospravedlnenie sa prezidenta Havla za vysídlenie sudetských Nemcov bolo prvým krokom na ceste k urovnaniu vzájomných vzťahov.
Ešte v decembri 1989 zaniklo združenie kňazov Pacem in terris, ktoré podporovalo bývalý režim a cirkvi obnovili svoje aktivity. 2.2.1990 obnovili činnosť predtým zakázané rehole, teologické fakulty prešli spod kontroly štátu do zväzkov univerzít. Počas rokovaní vo Vatikáne podpredseda vlády Ján Čarnogurský dohodol obnovenie normálnych diplomatických stykov i skoré vysvätenie nových biskupov (Korec, Tkáč, Kojnok, Baláž). Rada vzájomnej hospodárskej pomoci bola formálne zrušená v júni 1991.