Zmenilo sa nastupovanie náhradníkov, keď na rozdiel od predchádzajúcej úpravy, podľa ktorej nastupovali náhradníci najprv podľa počtu prednostných hlasov a potom podľa poradia na kandidátnej listine politickej strany, bolo uvedené, že nastupuje náhradník z tej istej strany a určí ho politická strana (§48 ods1). Namiesto poslanca, ktorý sa stal členom vlády nastúpil náhradník s tým, že jeho mandát trval len po dobu výkonu funkcie pôvodného poslanca vo vláde. Jedná sa o spočívajúci mandát.
V prípade, že by voľby boli vyhlásené za neplatné Ústavným súdom SR respektíve zrušením ich výsledkov, predseda NR SR vyhlási nové parlamentné voľby do 30 dní od nálezu Ústavného súdu.
Vzhľadom na obmedzujúce ustanovenia novelizácie volebného zákona, skupina poslancov podala podnet na Ústavný súd SR. V podaní žiadali predkladatelia vyhlásiť niektoré ustanovenia zákona za protiústavné (sporné sa javilo najmä ustanovenie, podľa ktorého je zakázaná volebná kampaň v súkromných médiách, ustanovenie podľa ktorého člen politickej strany nemôže byť na kandidátnej listine inej strany a ani v rámci koalície medzi kandidátmi inej koaličnej strany, ustanovenia o doplnení okrskovej volebnej komisie rozhodnutím prednostu okresného úradu namiesto starostu obce v prípade, že nemá dostatočný počet členov a ustanovenie o nepriamej novelizácii Občianskeho súdneho poriadku, na základe ktorej rozhoduje Najvyšší súd SR proti rozhodnutiu Ústrednej volebnej komisie o registrácii respektíve neregistrácii kandidátnej listiny15 ). Ústavný súd rozhodol až po vykonaní parlamentných volieb 18. marca 1999 nálezom č. 66 Z. z. Slovenskej republiky, že niektoré ustanovenia volebného zákona nie sú v súlade s Ústavou SR a Dohovorom o ochrane ľudských práv a slobôd (ustanovenie, ktoré povoľuje viesť volebnú kampaň iba v Slovenskom rozhlase a Slovenskej televízii a zakazuje ju viesť v súkromných médiách, ustanovenie, ktoré zakazuje v čase volebnej kampane vysielať volebné prejavy a programy a uverejňovať akékoľvek vonkajšie prejavy, ktorými sa propagujú kandidujúce politické strany, okrem vysielacieho času vyhradeného týmto stranám, ustanovenie, ktoré umožňuje určiť náhradníka na uprázdnený mandát politickej strane). Tieto ustanovenia stratili dňom publikácie v zbierke zákonov účinnosť a po 6. mesiacoch aj platnosť.
Posledná novelizácia volebného zákona č. 223/1999 Z. z. upravuje niektoré ustanovenia, najmä otázku volebných komisií, ktoré sa utvoria z rovnakého počtu zástupcov politických strán alebo politických hnutí alebo volebných koalícií politických strán, ktoré podávajú kandidátnu listinu. Politické strany sa môžu dohodnúť na podaní spoločnej kandidátnej listiny a vytvoriť tak koalíciu. Splnenie podmienok sa v prípade koalície zisťuje tak, akoby kandidátnu listinu podala jedna strana.