Dôležitou výnimkou z tohto pravidla je financovanie síl vzdušného systému včasného varovania a riadenia NATO, letky lietadiel na rádiolokačný prieskum vo vlastníctve aliancie, ktoré sú dislokované pod operačným velením a riadením veliteľa síl NATO podriadeného hlavným veliteľom aliancie. Zo spoločných fondov vynakladá NATO ďalej investície zamerané na realizáciu kolektívnych požiadaviek, za ktoré nemôže niesť zodpovednosť len jedna krajina. Ide napríklad o protivzdušnú obranu, systém riadenia a velenia či spojovacie systémy. Ďalej sem patria investície na údržbu, obnovu, odstránenie zariadení súvisiacich so zmenou požiadaviek technologického vývoja a tých spoločných požiadaviek NATO, ktoré predstavujú veľmi vysoké náklady. Určujúcim faktom pri zadávaní projektu na spoločné financovanie je poznanie, či požiadavka nemôže byť v plnej miere zabezpečená niektorou z členských krajín. Súčasne musia všetky krajiny potvrdiť, že financovanie projektu je v ich záujme. Požiadavka musí byť preto detailne vypracovaná a overená. Až tak sa môže stať impulzom na rozpracovanie komplexných národných a medzinárodných administratívnych procesov. Po uznaní požiadavky na výdavky sa musí posúdiť jej vhodnosť pre spoločné financovanie v stanovenom rozsahu. Stanovenie vhodnosti požiadaviek sa uskutočňuje formou konsenzu členských krajín. Kritériá pre spoločné financovanie sa neustále posudzujú a prípadné zmeny sa môžu uviesť do života na základe významnej zmeny podmienok (napr. v prípade potreby vytvoriť definíciu na určenie tej časti nákladov pre mierovú operáciu, ktoré by mali byť vložené do medzinárodného rozpočtu NATO a nákladov, ktoré by mali byť financované z národných rozpočtov). Akékoľvek zmeny dohôd v oblasti spoločného financovania môžu byť výsledkom organizačných a technologických zmien alebo môžu vyplývať priamo z potreby riadiť výdavky v rámci špecificky limitovaného financovania. Napriek zmenám, ktorým NATO objektívne podlieha, sa nemení základný princíp platný pre spoločné financovanie. Stále zostáva v platnosti, že akékoľvek zmeny sa môžu vykonať len po vzájomnej zhode.
TVORBA A POUŽITIE ROZPOČTU
Výdavky odsúhlasené na financovanie sú v plnej výške kryté z príspevkov členských krajín. Platí všeobecne uznávaná zásada, že členská krajina sa finančne podieľa na financovaní, ak sa podieľa aj na činnosti príslušnej organizačnej štruktúry NATO. Takto členské krajiny financujú výdavky na zabezpečenie chodu medzinárodného sekretariátu, medzinárodného vojenského štábu, vrátane integrovanej štruktúry velenia NATO a agentúr vojenského výboru. Výdavky, ktoré sa dotýkajú ďalších oblastí v rámci medzinárodných vojenských štruktúr, sú začlenené do Programu bezpečnostných investícií NATO (NSIP).